5日已有不少台湾媒体报道罹难人数升至12位，但花莲县政府当天数据始终为4日晚公布的10人。当天搜救队员在砂卡礑步道发现2名失联人员已无生命体征，但因落石压身无法将人移出。此2人为父女关系，他们的3位家人仍在该步道附近处于失联状态。6日下午，花莲县将罹难者人数确定为13人。

开云线上登录4月6日，花莲近海发生地震后的第四天，台当局灾害应变中心公布的罹难人数升至13人。新确认的3位死者系在太鲁阁砂卡礑步道失联人员，其中两位是父女关系。

高雄市特搜队负责人苏裕铭中午向中新社记者介绍，只能通过重型机具破坏压在父女遗体身上的巨石，但现在进行破石作业有可能导致塌方再次出现。目前还未找到5口家庭中剩下的3位失联人员。

花莲县政府当天发布的统计将“受困人员”的名称改为“留置人员”。当前，留置在太鲁阁山区的人数降至405人，还有6人失联。花莲县特搜队队长简弘丞向中新社记者介绍，仍留在天祥的民众大多是从台湾东部地区上山，他们希望还从东部道路返程。基于此，这些人就不再是“受困”了。

至于西宝小学受困的大批师生，搜救队6日携物资搭乘直升机飞抵并确认师生身体状况。队员返程时载回一名怀孕的老师和生病的学生，至晶英酒店。

搜救队于6日在砂卡礑发现的一位失联人员为此前确定的21岁女性，被发现时已无生命体征。队员当天将遗体从落石中移出并送往殡仪馆。

随着搜救队5日抢通天祥向西至武岭的道路，部分有条件的受困民众从晶英酒店驾车撤离。经过一夜大雨，搜救队员6日已检查抢通路段，超过200位受困人员6日自行离开。